房产证上注明共有份额为1%和99%，意味着房产的产权由两位或多位共有人按照该比例共同拥有。

一、共有份额的概念

共有份额是指在共有关系中，各共有人对共有物所享有的权益比例。在房产证上注明共有份额，是为了明确各共有人在房产中所享有的权益比例，避免因产权不明确而引发的纠纷。

二、1%和99%共有份额的含义

当房产证上注明共有份额为1%和99%时，意味着其中一位共有人拥有99%的产权，而另一位共有人仅拥有1%的产权。这种产权分配方式在实际操作中较为少见，但并非不可能。它可能源于某种特定的法律关系或约定，如家庭成员间的财产分配、合作投资等。

三、共有份额的法律效力

房产证上注明的共有份额具有法律效力，各共有人应当按照约定的比例享有和承担房产的权益和义务。例如，在房产出售、抵押、租赁等交易中，各共有人应当按照其份额享有相应的权益和承担相应的义务。

四、共有份额的变更

共有份额的变更需要遵循一定的法律程序。一般来说，共有人之间可以通过协议的方式变更共有份额，但需要办理相应的变更登记手续。此外，在某些情况下，如共有人之一死亡或丧失民事行为能力，其份额的继承或处理也需要遵循相关法律规定。

综上所述：

房产证上注明共有份额为1%和99%意味着房产的产权由两位或多位共有人按照该比例共同拥有。各共有人应当按照约定的比例享有和承担房产的权益和义务，并遵循相关法律规定进行变更和处理。

法律依据：

《中华人民共和国民法典》

第二百九十七条规定：

不动产或者动产可以由两个以上组织、个人共有。共有包括按份共有和共同共有。

第二百九十八条规定：

按份共有人对共有的不动产或者动产按照其份额享有所有权。

第二百九十九条规定：

共同共有人对共有的不动产或者动产共同享有所有权。

第三百条规定：

共有人按照约定管理共有的不动产或者动产；没有约定或者约定不明确的，各共有人都有管理的权利和义务。

这些法律条款明确了共有关系的法律基础和共有人的权利义务，为处理房产证共有份额问题提供了法律依据。

房产证上可以备注显示份额。

我们在办理房产证的时候，房产证上一般不会显示份额这个问题，也就是说后期在分配房屋产权的时候，所有的拥有人将会按照一定的比例进行分配。想要让房产有一个注明的份额，那么大家可以自己想写一份协议书，然后去公证处进行办理公证，这样后期在分割房子的时候，就可以按照事先注明的房屋产权进行分割，但是在领取房屋产权证书的时候，工作人员是不会在房产证上标明份额的。